يقول المتخصصون في علوم القرآن إن هذا الكتاب هو أول كتاب مصنف في علوم القرآن.
ذكر ذلك شيخنا الشيخ مساعد الطيار في كتابه (المحرر في علوم القرآن)، وكذلك ذكر ذلك شيخنا الشيخ عبد الرحمن بن معاضة الشهري في محاضراته الماتعة على الألوكة (شرح ألفية الشيخ عبد الله فودي في علوم القرآن).

وهو ليس من كتب علوم القرآن بالمعنى الشائع؛ فإنه لم يتعرض إلا لمباحث يسيرة جدا من علوم القرآن، ومعظم ما فيه يتعلق بمباحث النسخ في القرآن، ولكنه يحتوي على فوائد مهمة، تبين بعض النواحي التاريخية لتطور الكلام في علوم القرآن. مقدمة 
 مخطوط العقل: جار الله مجموع 1101 
 مخطوط فهم القرآن: السليمية 951 
 الفصل الأول: الحارث المحاسبي حياته ومذهبه العقلي 
 الفصل الثاني: كتاب الحارث (مائية العقل) 
 كتاب مائية العقل ومعناه واختلاف الناس فيه 
 من صور المخطوطات 
 النص المحقق 
 كتاب فهم القرآن ومعانيه 
 تمهيد 
 شرح وتلخيص 
 المقدمة 
 أفي تنزيه الله 
 بفي العقل 
 القسم الأول: فضائل القرآن 
 أفضائل القرآن 
 بفضائل القراء 
 القسم الثاني: في فقه القرآن 
 القسم الثالث: ما يجوز فيه النسخ وما لا يجوز فيه ذلك 
 1 صفات الله وأسماؤه 
 2 وأخباره تعالى عما كان ويكون 
 البدوات وحدوث الارادات 
 السمع والبصر 
 العلو 
 الحشوية والنسخ في الأخبار 
 أين يجوز النسخ 
 القول بخلق القرآن 
 القسم الرابع مع المعتزلة دفاع والتزامات 
 دعوى المعتزلة 
 في الوعد والوعيد 
 الزام المعتزلة 
 أامتناع الخوف والرجاء 
 بامتناع العفو 
 القسم الخامس: في ذكر الناسخ والمنسوخ من الأحكام 
 القسم السادس: من أساليب القرآن 
 التقديم والتأخير 
 الإضمار 
 الحروف الزوائد 
 الفصل والوصل 
 نص كتاب فهم القرآن 
 في تنزيه الله 
 في العقل 
 القسم الأول: فضائل القرآن 
 فضائل القراء 
 القسم الثاني: في فقه القرآن 
 القسم الثالث: في المحكم والمتشابه 
 القسم الرابع: باب ما لا يجوز فيه النسخ وما يجوز ذلك فيه 
 صفات الله وأسماؤه 
 أخباره تعالى عما كان ويكون 
 البداوات وحدوث الإرادات 
 السمع والبصر 
 العلو 
 الحشوية والنسخ في الأخبار 
 القول بخلق القرآن 
 القسم الخامس: مع المعتزلة دفاعات والزامات 
 دفاع عن أهل السنة 
 دعوى المعتزلة 
 في الوعد والوعيد 
 وأما قولهم لا يخلو من ثلاث خلال 
 وأحسن الأعمال التوحيد 
 فكل من أقر فقد آمن 
 إمتناع الخوف والرجاء 
 إمتناع العفو 
 امتناع شفاعة النبي 
 القسم السادس: ذكر الناسخ والمنسوخ في الأحكام 
 القسم السابع: في أساليب القرآن 
 باب التقديم والتأخير 
 الحروف الزوائد 
 المفصل والموصول 
 توثيق نسبة فهم القرآن إلى المحاسبي 
 الفهارس العامة 
 1فهرس المصادر والمراجع 
 2فهرس الأعلام 
 3فهرس الموضوعات  مقدمة 
 مخطوط العقل: جار الله مجموع 1101 
 مخطوط فهم القرآن: السليمية 951 
 الفصل الأول: الحارث المحاسبي حياته ومذهبه العقلي 
 الفصل الثاني: كتاب الحارث (مائية العقل) 
 كتاب مائية العقل ومعناه واختلاف الناس فيه 
 من صور المخطوطات 
 النص المحقق 
 كتاب فهم القرآن ومعانيه 
 تمهيد 
 شرح وتلخيص 
 المقدمة 
 أفي تنزيه الله 
 بفي العقل 
 القسم الأول: فضائل القرآن 
 أفضائل القرآن 
 بفضائل القراء 
 القسم الثاني: في فقه القرآن 
 القسم الثالث: ما يجوز فيه النسخ وما لا يجوز فيه ذلك 
 1 صفات الله وأسماؤه 
 2 وأخباره تعالى عما كان ويكون 
 البدوات وحدوث الارادات 
 السمع والبصر 
 العلو 
 الحشوية والنسخ في الأخبار 
 أين يجوز النسخ 
 القول بخلق القرآن 
 القسم الرابع مع المعتزلة دفاع والتزامات 
 دعوى المعتزلة 
 في الوعد والوعيد 
 الزام المعتزلة 
 أامتناع الخوف والرجاء 
 بامتناع العفو 
 القسم الخامس: في ذكر الناسخ والمنسوخ من الأحكام 
 القسم السادس: من أساليب القرآن 
 التقديم والتأخير 
 الإضمار 
 الحروف الزوائد 
 الفصل والوصل 
 نص كتاب فهم القرآن 
 في تنزيه الله 
 في العقل 
 القسم الأول: فضائل القرآن 
 فضائل القراء 
 القسم الثاني: في فقه القرآن 
 القسم الثالث: في المحكم والمتشابه 
 القسم الرابع: باب ما لا يجوز فيه النسخ وما يجوز ذلك فيه 
 صفات الله وأسماؤه 
 أخباره تعالى عما كان ويكون 
 البداوات وحدوث الإرادات 
 السمع والبصر 
 العلو 
 الحشوية والنسخ في الأخبار 
 القول بخلق القرآن 
 القسم الخامس: مع المعتزلة دفاعات والزامات 
 دفاع عن أهل السنة 
 دعوى المعتزلة 
 في الوعد والوعيد 
 وأما قولهم لا يخلو من ثلاث خلال 
 وأحسن الأعمال التوحيد 
 فكل من أقر فقد آمن 
 إمتناع الخوف والرجاء 
 إمتناع العفو 
 امتناع شفاعة النبي 
 القسم السادس: ذكر الناسخ والمنسوخ في الأحكام 
 القسم السابع: في أساليب القرآن 
 باب التقديم والتأخير 
 الحروف الزوائد 
 المفصل والموصول 
 توثيق نسبة فهم القرآن إلى المحاسبي 
 الفهارس العامة 
 1فهرس المصادر والمراجع 
 2فهرس الأعلام 
 3فهرس الموضوعات